De hoofdontwikkelaar van Assassin's Creed Shadows heeft bevestigd dat spelers geen cruciale inhoud zullen missen door zich te concentreren op een enkele hoofdrolspeler. Assassin's Creed Shadows biedt spelers een keuze tussen twee meeslepende personages: NAOE, een vrouwelijke shinobi en Yasuke, een historische Afrikaanse samurai-een keuze die een belangrijke pre-launch-discussie heeft gegenereerd.
Sommige fans waren bang dat het geven van één personage zou kunnen leiden tot gemiste verhaalelementen of gameplay -ervaringen. Jonathan Dumont, de creatief directeur, ging over deze zorgen en beschreef zijn eigen evenwichtige aanpak: "Ik heb de neiging om redelijk gelijkmatig te schakelen tussen personages. Ik zou bijvoorbeeld 3-5 uur met één protagonist kunnen doorbrengen, vervolgens schakelen en nog 2-3 uur spelen met de tweede."
Dumont verzekerde spelers echter dat het focussen op een enkel personage hun ervaring niet significant zal belemmeren. Terwijl elke hoofdrolspeler unieke openingssequenties en persoonlijke verhaallijnen beschikt, past het verhaal van de game zich aan aan het gekozen pad van de speler. Hij moedigt spelers aan om hun voorkeuren te volgen: "Ik geloof niet dat je veel zult missen. Het komt echt neer op je persoonlijke speelstijl. Je denkt misschien: 'Oké, ik zal zien hoe het spel aanpast op basis van welk personage ik kies.' Elke held heeft zijn eigen unieke introducties en speciale questlines, maar de kernervaring is flexibel.